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转录组分析的基本流程


转录组

背景资料 
# https://mp.weixin.qq.com/s/a3y46NNNO-wardO3XWwh0w

基本流程

流程:
1. 参考基因组、基因注释文件 下载 
2. 质控,需要fastqc及multiqc等
3. 比对:hisat2
4. 计数和归一化
5. 差异分析


流程参考:https://f1000research.com/articles/4-1070/v1
step1:
cat SRR_Acc_List.txt |while read id ;do (prefetch  ${id} &);done
ls /public/project/...

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